生物医学工程学科实力很强的大学主要有东南大学、华中科技大学、上海交通大学、清华大学、北京航空航天大学、浙江大学、四川大学、北京大学、天津大学、复旦大学、华南理工大学等。
目前教育部门并没有发布权威的生物医学科学专业大学排名,但是公布了基础医学学科大学排名情况,生物医学科学是基础医学类的下属专业。其中,北京大学、北京协和医学院被评为A+,复旦大学A,上海交通大学等4所高校被评为A-.
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